LBAGENVET 猫的遗传学 4.0:进化、品种、繁殖策略与近交

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猫,无论是悠然自得的家养宠物,还是栖息野外的独立猎手,都承载着数千年的进化故事。它们的外貌特征和行为模式既是自然选择的产物,又受到人类驯养和繁育的深刻影响。在这篇文章中,我们将从科学角度审视猫的进化历程、品种形成以及繁育策略的复杂性,尤其是近亲繁殖对猫群体的影响。通过探讨这些主题,您将不仅了解猫品种背后的遗传学原理,还能发现繁育实践对遗传健康的深远意义。无论是繁育者、兽医,还是对猫充满热情的爱好者,这篇文章都将为您提供独特的见解和丰富的知识背景。

猫的进化、驯化与品种

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现代家猫(Felis silvestris lybica)是中东野猫(Felis silvestris)的后代和亚种。猫的驯化过程有些令人惊讶:与大多数家养动物不同,猫(除了狮子)没有发达的社会结构,它们是独居动物,而不是群居动物。中东野猫有五个亚种,只有 Felis silvestris lybica 对现代家猫的遗传组成有贡献。目前的假设认为,大约在 9,000 年前,生活在今天土耳其以及中东“肥沃新月地带”的野猫逐渐习惯于与早期农业村庄共存。野生(或半驯化)猫与农民之间形成了一种互利共生关系。粮仓为老鼠提供了营养来源,而猫作为小型啮齿动物的天敌,以这些老鼠为食。

猫的驯化可能发生了许多次,涉及多个个体。此外,其他独立事件也促进了猫的驯化:例如,大约 3,000 年前在古埃及,猫被视为神灵。新驯化的猫很可能随着人类的迁徙和贸易路线的扩展传播。海上贸易进一步帮助家猫的全球传播,它们在航船上用于控制啮齿动物。

纯种猫品种的识别

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由于家猫与现代野猫被认为是同一物种,且两者可以轻松繁殖,家猫与野猫之间存在大量的基因交换。自然品种通过自然选择和繁殖在当地自然形成。而现代猫品种的历史只有不到 150 年。在 1871 年的英国,仅有 5 个猫品种被认可,而我们的现代猫品种主要是在过去 50 到 75 年间发展起来的。目前,CFA(猫迷协会)认可 41 个猫品种,而 TICA(国际猫协会) 认可 57 个猫品种。相比之下,今天世界范围内被认可的狗品种超过 400 个。

现代家猫

与狗和其他家养动物的情况不同,猫的驯化过程并未真正改变现代猫与其野生祖先相比的特征。因此,现代家猫的形态、生理和行为与它们的野猫亲戚相似:它们首先是以小型啮齿动物为捕食对象的捕食者。现代家猫在必要情况下可以轻松自给自足,这解释了与城市中心相关的野生化猫群体的存在。这也解释了为什么猫被认为是我们家养动物中驯化最少(或最独立)的。

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纯种猫的定义

一般来说,现代家猫(你可以称之为“巷猫”)并非血统猫的后代,其优势在于开放且均衡的遗传基础。而纯种猫品种通常来源于家猫的遗传构成。现代狗的情况则有所不同。至少在西方社会,混种狗或杂种狗通常都带有纯种狗的遗传基因。

对于猫来说,品种的定义通常基于简单的遗传性状(如毛色和毛发类型),而不是更复杂的行为或生产性状的遗传学。猫的繁育者经常提到“血统猫品种(pedigreed cat breeds)”,而不是“纯种猫品种(purebred cat breeds)”。一个新猫品种通常只是现有品种的毛色或毛发变种。如果新品种的种群规模较小,且被排除在母品种的遗传基因库之外,这可能会引发近交问题

对于猫来说,人工遗传屏障(如封闭的血统书)可以比狗的屏障宽松,也可以同样严格。因此,狗繁育者所面对的繁育策略和近交问题同样适用于猫繁育者(详见近交部分)。

繁育策略

猫的繁育者可以采用多种繁育策略,包括:

  • 近交Inbreeding
    近交是指将同一家族的动物进行繁育,这些动物在谱系的父系和母系两侧具有共同的祖先。这种方式可以在后代中固定所需的表型,但同时会减少后代的遗传变异。与父母相比,近交会增加后代的近交系数。近交的另一个名称是近亲繁殖
  • 系谱繁育Line breeding
    系谱繁育是指繁育同一品种中来自不同血统(系谱)的动物,这些动物具有相似的特征,但很少或没有共同的祖先。这种方式在保持品种所需特征的同时,也能在后代中维持均衡的遗传基础。后代的近交系数与父母大致相同。但并非所有猫品种都有足够的个体数量来支持系谱繁育。
  • 外交繁育Outbreeding
    外交繁育是指繁育来自完全不同血统的同一品种或相似品种的动物,这些动物没有共同的祖先,其特征不一定相似。所需的物理特征可能无法在后代中维持。与父母相比,后代的遗传变异增加,近交系数降低。
  • 杂交繁育Crossbreeding
    杂交繁育是指繁育两个不同品种的动物,这些动物没有共同的祖先。后代既不保持父系的特征,也不保持母系的特征。与父母相比,后代的遗传变异增加,近交系数降低。

谱系

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谱系是记录动物血统及其祖先的官方记录。它是繁育俱乐部注册新动物所需的官方记录的重要组成部分。谱系也是研究动物遗传学的重要资源,可用于估算特定祖先的遗传贡献以及确定两个个体之间的遗传关系。此外,谱系还用于计算动物的近交系数。

谱系的组织形式类似于树的分支。在标准格式中,父系的贡献位于上方,母系的贡献位于下方。每一代祖先的遗传贡献都以二分之一的比例递减。例如,一个动物(后代)有两个父母,每个父母对其遗传组成贡献了 50%;有四个祖父母,每个祖父母对其遗传组成贡献了 25%,以此类推。

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近交

当具有共同祖先的两只动物交配时,其后代就处于近交状态。近交对后代的表型有以下两方面影响:

  1. 表型的一致性增加
    • 后代的“类型”(表型)更加一致。
    • 遗传优势增加,即父母将某种表型传递到下一代的能力增强。这种表型一致性对繁育者来说是理想的。
  2. 近交衰退
    • 表现为生命力下降、体重减轻、繁殖力降低、成长速度减缓。
    • 先天性异常率和死亡率增加,隐性遗传疾病发生率增加,寿命缩短。

从基因组的层面来看,近交会增加纯合基因型(N/N, M/M)的比例,并减少杂合基因型(M/N)的比例。隐性突变基因会以纯合形式(M/M)积累,从而增加隐性遗传疾病的频率,这也加剧了近交衰退的负面影响。

简而言之,大自然不喜欢表型或基因型上的一致性,更倾向于多样性和差异性。

现代纯种猫品种在定义上几乎都属于近交群体
以下因素导致纯种猫群体具有近交特性:

  • 建立品种时的基础种群数量有限。
  • 品种的封闭血统书。
  • 在下一代繁育中仅使用少部分种猫(例如“冠军猫效应”或“受欢迎的种公效应”)。

亲缘系数 (a) 与近交系数 (COI)

1921-22 年,美国数学家兼遗传学家 Sewall Wright 定义了两个基于遗传谱系的数学值:亲缘系数 (a)近交系数 (COI)
这两个值对家养动物繁育的科学和实践非常有用。

  • 它们并不代表动物的具体 DNA 或基因,而是基于所有基因遵循简单孟德尔遗传规律(显性和隐性等位基因)的假设计算得出。尽管这一假设过于简化,但亲缘系数和近交系数在实践中仍然具有很高的应用价值。

这些系数可以用来:

  • 估算两只动物之间的遗传关系。
  • 估算某个动物基因组中的遗传多样性(或缺乏遗传多样性)。
  • 评估未来几代由于过度近交而可能导致的不良健康影响(即近交衰退)的风险。

亲缘系数 (a)

亲缘系数估算两只动物之间的谱系中共有 DNA 的数量。计算公式如下:

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  • a:两只动物之间的亲缘系数。
  • 1/2:每位父母对其后代的遗传贡献比例。
  • n:两只动物之间的世代间隔数(即谱系中两者之间的“路径”数量)。
  • Σ:谱系中所有可能连接两只动物的路径的总和。

如果两只动物没有遗传关联,则亲缘系数为 0。
如果它们在谱系中存在关联,则亲缘系数大于 0,可以根据上述公式计算。

近交系数 (COI)

近交系数(COI,或称“F”)估算个体因谱系中存在共同祖先而导致的遗传多样性损失。公式如下:

COI = (1/2)^n+1

更完整的近交系数公式为:

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  • F:目标个体的近交系数。
  • 1/2:每位父母对其后代的遗传贡献比例。
  • n:从共同祖先到目标个体之间的世代间隔数。
  • +1:因共同祖先出现在父系和母系中的预期遗传多样性损失的附加因素。
  • Σ:谱系中每位共同祖先的贡献总和。
  • Fa:共同祖先本身的近交系数。

如果共同祖先本身也有共同祖先,则需进一步计算其近交系数,并将其作为修正因子纳入公式中:(1 + Fa)

对于对数学公式感兴趣的冒险家和喜欢挑战的灵魂,这些公式可以变得更复杂:

这些复杂公式进一步探索了亲缘系数和近交系数的精确计算过程。

亲缘系数与近交系数示例

以下是父母没有共同祖先的情况下,亲缘系数(Coefficient of Relation,表示共享 DNA 的平均比例)以及其假设后代的近交系数(Coefficient of Inbreeding,用于衡量遗传多样性的损失)的示例:

关系亲缘系数 (a)后代的近交系数 (COI)
父母与子女50%25%
兄妹50%25%
祖父母与孙子女25%12.5%
叔伯/姨与侄子女25%12.5%
同父异母/同母异父兄妹25%12.5%
表兄妹/堂兄妹12.5%6.25%
半表兄妹6.25%3.125%
第二代表兄妹3.13%1.063%

例如,一个孩子与其父母共享 50% 的基因,因此其与父母之间的亲缘系数为 50%。但是,该子女的近交系数为 0。然而,若发生父母与子女之间的近亲交配,或兄妹之间的交配,其后代的近交系数将达到 25%。这意味着,从 DNA 的角度来看,平均会有 25% 的遗传多样性丧失(M/N 减少),而 25% 的基因纯合性增加(N/N 或 M/M 增加)。因此,进步的育种俱乐部通常禁止近亲繁育。

在人类法律中,表兄妹之间的婚姻通常是被允许的,即使这种婚姻的后代近交系数为 6.25%

近交与遗传多样性的丧失

当近交系数为 10% 时,这意味着对于某些在共同祖先中以杂合状态(M/N)存在的遗传位点,后代有 10% 的几率转变为纯合状态(N/N 或 M/M)。换句话说,近交引起的配对将导致后代平均丧失 10% 的遗传多样性,或增加 10% 的遗传一致性。这种由共同祖先引起的杂合到纯合的遗传位点被称为“来源一致性(identical by descent)”。

谱系

在计算近交系数时,应考虑谱系中的多少代?

  • 可用的代数越多,计算结果越可靠。
  • 使用较少的代数会导致系数值低估。
  • 实际操作中,应尽可能使用所有可用的谱系信息,无论是少至三代,还是覆盖到品种基础动物的全部代数。

感谢育种者的善意以及互联网的力量,大量的猫谱系记录可在专门网站上找到。例如:PawPeds 网站 提供了猫谱系数据。
在这些平台上,您可以查看某只猫的已知谱系、标记其共同祖先,并计算近交系数。平台还提供“虚拟配对”功能,用于计算和比较未来潜在繁育组合的近交系数。

使用近交系数

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正确使用近交系数,育种者可以在选择未来一代猫的父母时做出明智决策。

  • 近交系数是个体基因组健康状态的全球性指标
  • 更具体来说,近交系数基于谱系分析,代表由于存在共同祖先导致的遗传多样性丧失的百分比估算。
  • 当谱系中父母两侧存在共同祖先时,原本在共同祖先中为杂合状态(M/N)的遗传位点可能在后代中转变为纯合状态(N/N 或 M/M)。这种情况被称为“来源一致性”。

遗传多样性的丧失通常是不利的,因为它可能导致近交衰退。而外交繁育杂交繁育则可以增加遗传多样性,从而表现出 杂种优势(heterosis)。杂种优势是近交衰退的对立面。

近交系数的解释

较高的近交系数表明可能出现近交的负面影响(如近交衰退)。然而,高近交系数也增加了固定品种相关理想特征的几率。因此,近交系数是一个需要权衡利弊的指标。

  • 当近交系数高于 5% 时,近交的负面影响会开始显现。
  • 建议保持近交系数低于 10%,以在固定特征和避免负面影响之间取得平衡。
  • 系数高于 12.5% 的近亲交配(如父母与子女、兄妹、祖孙等)应避免。

一般建议

  1. 选择繁育组合以降低后代的近交系数。
  2. 避免谱系中最近 3 至 4 代内有共同祖先的繁育个体。
  3. 避免近亲繁育(近交系数 ≥ 12.5%)。
  4. 尽量将近交系数保持在 10% 以下,理想情况下低于 5%
  5. 为了品种的基因组健康,可适当牺牲个体的某些外观特征。

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© 2019 Dr. David W. Silversides

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